2000年冬，南极洲

这本是一片及其寒冷的让生命无法存活的冰雪领域，然而人类却依靠引以为傲的科技来到了这里。

站在考察队的破冰船上，虽然穿着厚厚保暖棉衣，极低的温度仍然让科考队员们难以忍受。但是此时他们心中却一片火热，这次极地之旅的发现对于人类而言绝对是具有跨时代意义的。一个偶然的机会，在绝不该存在生命的冰层之下却探测出了生命反应，在数次的勘察确认后，X光的透视镜下映射出的是一枚卵状物质。

卵，就是生命存在的最初始状态。

这一发现引起了全世界的广泛关注，联合国政府派遣“人工进化智能研究所”的碇元渡、冬月带领科考队赶赴南极洲。正本该是一次具有重大意义的行动，如果能发现冰层下有生命体存在，无疑对为人类乃至整个生物界的生存做出巨大的贡献。然而，这却成了噩梦的开端。当时作为研究所所长的碇元渡在卵周围发现有类似原始汤类的粘稠液体。

这一发现足以轰动世界，但是更让人为之惊诧的，是这一切在两千年前就被记录在了《死海文书》之中——那一本代表着禁忌的神的预言......

“在世界最南端是死亡的极寒，那里埋藏着莉莉斯之卵”

这是《死海文书》中的一句话。( 手、打。吧更新超快)这本书本来只是不被人放在心上的死海附近古文明的参考文献，而其中这微小的一句话更是仅仅被当做一个异族中流传的神话，然而随着莉莉斯的发现，人们终于感到了恐惧......

“我要将我的子民带回我的国,在那应允之日,我要你们回归到最初的的生命,以最初的形态回到我的坐前......

到约定的那日，所有的人类将无分彼此，回归最初的形态，再无心的隔阂，灵魂融为一体，其名为——人类补完计划。”

原本只是茶余饭后的笑谈，却很可能成为世界末日的预言。这令得所有知情人士强烈的恐慌起来，他们开始试图证实莉莉斯的虚假，妄图在其中寻得一线生机。

总之，莉莉斯挖掘的工作理所当然迅速地展开了。

然而谁也没有料到的是，人类亲手挖掘出的是怎样的恶魔。不，或许它并不能称之为恶魔，而应被叫做天使，毁灭了人类的天使——使徒原来“莉莉斯之卵”中沉睡的并不止是莉莉斯，还有和她融为一体的亚当。当人类将插在其胸口的那柄长枪（朗基努斯之枪）拔起，亚当（第一使徒，身形在背后有着巨大光之翼）与莉莉斯（第二使徒，白色拥有七只眼的巨人）便相继觉醒。他们拥有人类无法理解的力量。

虽然依靠科技，人类重创了当时尚没有完全觉醒的两只使徒，其中第一使徒亚当被迫回归“莉莉斯之卵”，而第二使徒莉莉斯则被重伤至只剩残体，被碇元渡秘密运回，以朗基努斯之枪将其再次封印，钉在NERV本部下方的十字架上。第一次对抗使徒的行动获得了成功，然而付出的代价却是整个世界一半人类的生命。

这是一场无法弥补的浩劫，其真相被联合国政府掩盖，对外界谎称这是陨石撞击带来的灾害。

这场浩劫被命名为“第二次冲击”。

然而噩梦还远远未结束。觉醒的使徒并不止亚当和莉莉斯，一切仿佛都按着《死海文书》中导演的方向发展着，随后等待着人类的是“第三次冲击”——世界的毁灭。

为了阻止“第三次冲击”的发生，联合国政府成立了SELEE机关委员会。这是一个全权控制全世界所有兵权、资金的庞大组织，其成员为各国的首脑，平时以全息影像出现并参与会议。同时“人工进化智能研究所”正式更名为“NERV”，作为SELEE下辖特务机关，碇元渡任司令一职。

次年3月初，受第二次冲击的影响，中国某地突然出现一座从未发现过的陵墓。中国政府为防止再次发生”莉莉斯事件”，立即封锁了这条消息。此后经过长达三个月的缓慢探索，在付出了上百人牺牲的状况下，考察队终于成功地获取了陵墓中保存的东西。至此，中国EQUALITY组织建立，其政府开始积极地加入到SELEE机关委员会之中......

“第二次冲击”让人类深切感到自身力量的不足。为此，NERV以碇元渡为首提议――开发以第一使徒亚当为蓝本的战斗兵器。这一提议立刻得到了SELEE的认同与支持，并将这一新诞生的战斗兵器命名为EVANGELION（EVA）......

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